从头合成(denovo synthesis):生物体内用简单的
前体物质合成
生物分子的途径。
合成途径
体内
核苷酸的合成有两条途径:①利用磷酸
核糖、氨基酸、一碳单位及等简单物质为原料合成核酸的过程,称为从头合成途径(denovo synthesis),是体内的主要合成途径。②利用体内游离
碱基或
核苷,经简单反应过程生成核苷酸的过程,称重新利用(或补救合成)途径(salvage pathway)。在部分组织如脑、骨髓中只能通过此途径合成核苷酸。
嘌呤核苷酸的主要补救合成途径是
嘌呤碱与在磷酸核糖转移酶作用下形成嘌呤核苷酸。
合成过程
嘌呤核苷酸的从头合成
早在1948年,Buchanan等采用
同位素标记不同化合物喂养鸽子,并测定排出的尿酸中标记原子的位置的同位素示踪技术,证实合成
嘌呤的前身物为:氨基酸(
甘氨酸、
天门冬氨酸(天冬氨酸)、和谷氨胺)、和一碳单位。
随后,由Buchanan和Greenberg等进一步搞清了
嘌呤核苷酸的合成过程。出人意料的是,体内嘌呤核苷酸的合成并非先合成
嘌呤碱基,然后再与
核糖及磷酸结合,而是在磷酸核糖的基础上逐步合成嘌呤核苷酸。嘌呤
核苷酸的从头合成主要在胞液中进行,可分为两个阶段:首先合成
次黄嘌呤核苷酸(inosine monophosphate IMP);然后通过不同途径分别生成。下面分步介绍嘌呤核苷酸的合成过程。
IMP的合成
1.IMP的合成:IMP的合成包括11步反应:
(1)5-磷酸核糖的活化:
嘌呤核苷酸合成的起始物为,是
戊糖磷酸途径代谢产物。嘌呤核苷酸生物合成的第一步是由
磷酸戊糖焦磷酸激酶(
核糖 磷酸盐 pyrophosphohinase)
催化,与
atp反应生成。此反应中ATP的焦磷酸根直接转移到5-磷酸核糖C1位上。PRPP同时也是核苷酸及
组氨酸、
色氨酸合成的
前体。因此,磷酸戊糖焦磷酸激酶是多种生物合成过程的重要酶,此酶为一变构酶,受多种代谢产物的变构调节。如PPi和2,为其变构
激活剂。ADP和GDP为变构抑制剂。
(2)获得
嘌呤的N9原子:由磷酸
核糖酰胺转移酶(amidophosphoribosyl transterase)
催化,谷氨酰胺提供酰胺基取代
PRPP的
焦磷酸基团,形成。此步反应由焦磷酸的
水解供能,是嘌呤合成的限速步骤。酰胺转移酶为限速酶,受
嘌呤核苷酸的反馈抑制。
(3)获得嘌呤原子:由
甘氨酰胺核苷酸合成酶(glycinamide ribotide synthetase)催化
甘氨酸与PRA缩合,生成甘氨酰胺核苷酸(glycinamide ribotide,GAR)。由
atp水解供能。此步反应为可逆反应,是合成过程中唯一可同时获得多个原子的反应。
(4)获得
嘌呤原子:GAR的自由α-
氨基甲酰化生成甲酰甘氨酰胺核苷酸(formylgly?cinamide ribotide FGAR)。由。
催化此反应的酶为GAR甲酰转移酶(GAR transtormylase)。
(5)获得嘌呤的原子:第二个谷氨
酰胺的酰胺基转移到正在生成的嘌呤环上,生成甲酰甘氨
核苷酸(formylglycinamidine ribotide,FGAM)。此反应为耗能反应,由
atp水解生成供能。
(6)
嘌呤咪唑环的形成:FGAM经过耗能的分子内重排,
环化生成
(7)获得嘌呤,由AIR羧化酶(AIR carboxylase)
催化生成
羧基氨基咪唑核苷酸(carboxyamino imidazole ribotide,CAIR)。
(8)获得N1原子:由
天门冬氨酸与AIR缩合反应,。此反应与(3)步相似,由
atp水解供能。
(9)去除
反丁烯二酸:SACAIR在SACAIR
甲酰转移酶
催化下脱去延胡索酸生。(8)、(9)两步反应与
尿素循环中
精氨酸生成
鸟氨酸的反应相似。
(10)获得:
嘌呤环的最后一个C原子由提供,由AICAR甲酰转移酶催化AICAR甲酰化生成,FAICAR)。
(11)
环化生成IMP:FAICAR脱水环化生成 IMP。与反应(6)相反,此环化反应无需
atp供能。
由IMP生成AMP和GMP
2.由IMP生成AMP和GMP
上述反应生成的IMP并不堆积在细胞内,而是迅速转变为AMP和GMP。AMP与IMP的差别仅是6位
酮基被
氨基取代。此反应由两步反应完成。(1)
天门冬氨酸的氨基与IMP相连生成
腺苷酸代琥珀酸(adenylosuccinate),由腺苷酸代琥珀酸合成酶催化,GTP
水解供能。(2)在腺苷酸代琥珀酸裂解酶作用下脱去
反丁烯二酸生成AMP。
GMP的生成也由二步反应完成。(1)IMP由IMP脱氢酶
催化,以NAD+为受氢体,氧化生成
黄嘌呤核苷酸(xanthosine monophosphate,XMP)。(2)谷氨
酰胺提供酰胺基取代XMP中C2上的氧生成GMP,此反应由GMP合成酶催化,由
atp水解供能。
一磷酸核苷磷酸化
要参与
核酸的合成。一磷酸核苷必须先转变为二磷酸核苷再进一步转变为
核苷三磷酸。二磷酸核苷由
碱基特异的核苷一磷酸激酶(nucleoside monophosphate kinase)
催化,由相应一磷酸核苷生成。例如腺苷激酶催化AMP磷酸化生成ADP
二磷酸核苷激酶对底物的碱基及
戊糖(
核糖或
脱氧核糖)均无特异性。此酶催化反应系通过“乒乓反应”,即底物NTP使酶分子的组氨酶残基磷酸化,进而催化底物NDP的磷酸化。反应,为可逆反应。
从头合成的调节
从头合成是体内合成嘌呤核苷酸的主要途径。但此过程要消耗氨基酸及
atp。机体对合成速度有着精细的调节。在大多数
细胞中,分别调节IMP,ATP和GTP的合成,不仅调节嘌呤核苷酸的总量,而且使ATP和GTP的水平保持相对平衡。
IMP途径的调节主要在合成的前二步反应,即
催化PRPP和PRA的生成。核糖磷酸焦磷酸激酶受ADP和GDP的反馈抑制。磷酸核糖酰胺转移酶受到ATP、ADP、AMP及GTP、GDP、GMP的反馈抑制。ATP、ADP和AMP结合酶的一个抑制位点,而GTP、GDP和GMP结合另一抑制位点。因此,IMP的生成
速率受腺嘌呤和
鸟嘌呤核苷酸的独立和协同调节。此外,PRPP可变构激活磷酸
核糖酰胺转移酶。
第二水平的调节作用于IMP向AMP和GMP转变过程。GMP反馈抑制IMP向XMP转变,AMP则反馈抑制IMP转变为
腺苷酸代琥珀酸,从而防正生成过多AMP和GMP。此外,腺嘌呤和鸟嘌呤的合成是平衡。GTP加速IMP向AMP转变,而
atp则可促进GMP的生成,这样使腺嘌呤和鸟嘌呤核苷酸的水平保持相对平衡,以满足
核酸合成的需要。
参考资料
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