哈尔滨工程大学经济管理学院源自始建于1984年的管理工程系，1996年改制为经济管理学院，是哈尔滨工程大学首批成立的二级学院之一。

截至2018年，哈尔滨工程大学经济管理学院下设有工商管理系、经济学系、公共管理系和管理工程系，开设有6个本科专业，4个一级硕士点和1个硕士点。

1985年，成立管理工程系并招收第一届硕士研究生；

1987年，招收第一届本科生；

1995年，获管理科学与工程一级学科博士学位授权点；

1996年，成立经济管理学院；

1997年，获工商管理硕士（MBA）试办权；

2001年，获管理科学与工程博士后科研流动站，获工商管理硕士（MBA）专业学位授权点；

2003年，招收第一届工程硕士；

2005年，获工商管理、应用经济学一级学科硕士点和教育经济与管理二级学科硕士点；

2007年，获公共管理硕士（MPA）专业学位授权点；

2009年，获高级管理人员工商管理硕士（EMBA）专业学位授权点；

2010年，获公共管理一级学科硕士点和金融工程领域工程硕士专业学位授权点；

2012年，管理科学与工程学科在教育部第二轮学科评估中排名第24位；

2017年，管理科学与工程学科在教育部第四轮学科评估中获B+等级。

学院面向国家战略和区域需求，积极开展与地方政府及企事业单位的科技合作，近5年，主持国家自然科学基金、国家社会科学基金、国家软科学研究计划等各类科研课题200余项，发表文章600余篇，获得省部级奖励55项，科研到款3000余万元学院在促进科研成果转化创新，服务行业和地方经济社会发展，尤其是在区域创新系统建设、黑龙江省装备制造业发展、资源型城市转型等方面的研究取得了突出成果。

学院积极拓展国际合作渠道，与加利福尼亚州理工大学、美国内华达大学、美国西密歇根大学、英国斯特拉思克莱德大学、利兹大学、新加坡国立大学、堪培拉大学、早稻田大学、英国帝国理工学院等20余所高校签订联合办学协议或保持密切合作关系，开展了广泛的教学、科研合作与学术交流；与蒂尔堡大学危机研究所、清华大学中国企业成长与经济安全研究中心等国内外研究机构保持良好合作关系。学院每年邀请国内外专家学者来院授课或举办学术报告会20余人次，每年选派师生参加国内外学术会议和进修培训100余人次。

学院连续6年主办危机管理国际会议，先后承办中国管理科学与工程学会年会、中国高校市场学年会、中国高质量MBA教育认证培训会、全国科技评价学术研讨会、中国创新与企业成长年会、中国系统工程学会年会分会、ICeRM-2008EI分会、ICEIS-2011EI分会、黑龙江省管理学学会年会等高水平学术会议，与中国中国国际工程咨询有限公司等企业签订战略合作协议。

学院现已凝练形成创新管理、船海经济与管理、危机响应与管理信息系统、技术与创业管理、国防科技工业管理等特色研究方向。现有黑龙江区域创新驱动发展研究中心、企业创新研究所、船舶工业经济管理研究所、灾难与危机管理研究所、绿色技术管理与科技创业研究中心和知识产权管理研究所等研究机构，其中，黑龙江区域创新驱动发展研究中心为黑龙江省首批重点高端智库并入选工业和信息化部智库名录，企业创新研究所和灾难与危机管理研究所为黑龙江省高校人文社科重点研究基地，企业创新研究所和绿色技术管理与科技创业研究中心为哈尔滨工程大学“兴海”学术团队。同时学院还是“黑龙江省管理学学会”、“黑龙江危机科学与技术研究会”、“黑龙江省知识产权学会”3个省级学会组织的发起单位。

截至2018年，哈尔滨工程大学经济管理学院下设工商管理系、经济学系、公共管理系、管理工程系。

截至2018年，哈尔滨工程大学经济管学院有教职工108人，其中专任教师93人，教授29人，副教授38人；博士生导师32人，硕士生导师71人。专任教师博士化率达到95%，绝大多数教师具有出国学习、进修或访问的经历。现有学校“兴海”学术团队2个、国务院政府特殊津贴获得者2人、龙江学者特聘教授2人、教育部新世纪人才3人、黑龙江省优秀中青年专家2人，以及黑龙江省科顾委专家、黑龙江省对俄经贸专家顾问、哈尔滨市政府顾问等为代表的专家学者。学院还以柔性人才的方式聘请,长江学者、国家杰出青年基金获得者等一大批国内外著名大学和企事业单位学者、专家为兼职教授或博（硕）士生导师。

工商管理、经济学专业获评黑龙江省重点本科专业；《国际商法》、《市场营销学》、《经济预测》和《行政法学》等四门课程被评为黑龙江省精品课程；《市场营销学》获“第七届全国多媒体课件大赛”高教文科组一等奖；学院建有黑龙江省省级实验教学示范中心——经济管理实验中心。

《大学生研究性学习模式及配套机制研究》等20余个项目获省级教改立项，其中10余项课题获黑龙江省高等教育教学成果奖；《国防工业企业与管理》、《经济预测》、《管理建模与仿真》分获工业和信息化部“十一五”、“十二五”规划教材专著立项；刘希宋等7名教授获评黑龙江省优秀研究生导师；李拓晨教授获校“十二五”教学工作先进个人；学院共有60余名教师获评哈尔滨工程大学优秀主讲教师。