中国科学院苏州生物医学工程技术研究所（简称“苏州医工所”）是由中国科学院、江苏省和苏州市人民政府三方共同建设的国立研究机构。

2008年8月，中国科学院委托长春光学精密机械与物理研究所负责中国科学院苏州生物医学工程技术研究所的筹建工作。2012年7月，中编办正式批复成立中国科学院苏州生物医学工程技术研究所；8月，中国科学院发文正式成立中国科学院苏州生物医学工程技术研究所；11月，中国科学院苏州生物医学工程技术研究所正式通过验收成为中国科学院序列研究所。研究所围绕医用光学技术、医学检验技术、医学影像技术、医用声学技术、医用电子技术、康复工程技术、生物医用材料等研究方向，设立了9个研究室。截止2024年3月，已建成半导体照明联合创新国家重点实验室——光与健康研究基地（苏州）、中国科学院生物医学检验技术重点实验室、江苏省医用光学重点实验室、中国科学院先进体外诊断技术工程实验室、江苏省医用微细制造工程实验室、江苏省光电医疗仪器工程技术研究中心和11个苏州市高技术重点实验室。研究所园区占地面积208亩，现有总建筑面积7.8万平方米的科研及配套用房，装备投入3.1亿元，总资产12亿元。 

截至2023年12月底，人员总量1300余人，累计授权专利近1500项，其中发明专利700余项；发表高水平研究论文1400多篇。共承担国家、中国科学院及省市各类科技项目、企业委托项目1300余项，科研经费总额20亿元。

为填补中国国内在医疗器械装置研究等生物医学工程产业领域的空白，响应国家《中长期科技发展规划纲要（2006-2020）》要求，2008年2月，中科院与江苏省、苏州市共建“中国科学院苏州生物医学工程技术研究所”。

2008年8月，中编办正式批复成立中科院苏州医工所，中国科学院委托长春光学精密机械与物理研究所负责苏州医工所筹建工作；8月29日，中国科学院星发文正式成立中科院苏州医工所；10月，长春光学精密机械与物理研究所与虎丘区签订了《筹建备忘录》。

2009年6月，苏州医工所园区正式开工奠基。

2010年3月，院省市三方签订《二期建设协议书》，明确了一二期建设经费共7.8亿元，建设用地208亩。12月，所园区落成启用。

2012年11月，中国科学院苏州生物医学工程技术研究所正式通过验收委员会（由中科院、江苏省、苏州市及国家有关部委领导组成）验收。

2020年，入选“第三批双创示范基地名单”。

研究所围绕医用光学技术、医学检验技术、医学影像技术、医用声学技术、医用电子技术和康复工程技术等研究方向，设立了9个研究室。已建成半导体照明联合创新国家重点实验室——光与健康研究基地（苏州市）、中科院生物医学检验技术重点实验室、江苏省医用光学重点实验室、中科院先进体外诊断技术工程实验室和9个苏州市高技术重点实验室。研究所园区占地面积208亩，现有总建筑面积7.8万平方米的科研及配套用房，装备投入3.1亿元，总资产12亿元。

截止2022年6月，人员总量1200余人：其中国家重大人才工程项目13人，中国科学院星重大人才工程项目23人，江苏省双创人才19人，江苏省双创团队5个;研究员84人，副研究员138人;博士生导师46人，硕士生导师82人，在学研究生400余人。硕士及以上学历占98%，35岁及以下青年职工占68%。累计授权专利近1400项，其中发明专利430余项;发表高水平研究论文1900篇。共承担国家、中科院及省市各类科技项目、军工项目、企业委托项目1200余项，科研经费总额15.1亿元。

2018年底，由苏州医工所承担的国家重大科研装备研制项目“超分辨显微光学核心部件及系统研制”通过验收，标志着中国具备了高端超分辨光学显微镜的研制能力。历时五年攻关，全面突破大数值孔径物镜、特种光源、新型纳米荧光增强试剂、系统集成与检测等关键技术，研制出激光扫描共聚焦显微镜、双光子显微镜、受激发射损耗(STED)超分辨显微镜、双光子-STED显微镜等高端光学显微镜整机;建成了高端显微光学加工、装调、检测以及显微镜整机技术集成工程化平台，培养出一支具备研制复杂精密高端光学显微镜能力的研发团队，为中国高端光学显微镜的发展提供了系统解决方案。研制的超分辨显微镜或核心部件已在国内外多家研究机构、企业实现销售使用并已取得部分成果。

苏州医工所积极践行以需求为牵引的科技创新和成果转化机制创新双轮驱动发展模式，努力构建集团式新型研发机构。搭建了独具特色的价值5000多万元的包括设计、加工、测试与检验等功能的工程化平台，组建了近百人的专业化工程技术队伍，为医疗器械科技成果的放大实验和工程化提供技术保障，有效降低医疗器械产业化风险，高端工程化技术服务特色显著;成果转化模式逐步得到了各界的认可，在国内外多个地区建立了域外研究单元，实现了模式输出。

苏州医工所已成功孵化项目公司58家，注册资本9.3亿元，吸引社会投资5.4亿元。水性胶微柱凝胶产品、时间分辨能量分析仪、超声溶栓治疗仪等项目已顺利转移转化，深层光谱治疗仪、三重四级杆质谱仪、血栓弹力图仪、流式细胞仪等拿到医疗器械产品注册证并转让给企业。陆续获批江苏省产业技术研究院专业所、国家级专业化众创空间和国家级双创示范基地。

医疗器械的竞争是全球化的，其技术创新和产品研发亦是全球化的。研究所已与欧美、“一带一路”国家及地区等机构建立了全面的战略合作关系，通过项目合作、人员交流培训、共建研发中心和联合实验室等多种方式，吸引国际先进技术和高端人才。设立成果转化海外中心，推动技术成果转移转化。

苏州医工所将以习近平新时代中国特色社会主义思想为指引，在中国科学院的正确领导下，在地方各级政府和社会各界的大力支持与帮助下，脚踏实地、锐意创新，加强基础研究和关键技术攻关，努力实现“四个率先”和“两加快一努力”的奋斗目标，为推动中国医疗器械产业创新发展贡献力量，为实现中华民族伟大复兴的“中国梦”而努力奋斗。