于都站位于赣州市于都县贡江镇东溪村于银大道和站前南路交汇处，位属于都城区北部，交通便利。隶属中国铁路南昌局集团有限公司赣州车务段管辖。

于都火车站现为三等站，截至到2020年1月15日（国铁集团12306网站数据），每天有40趟列车停靠，其中普速火车4趟，和谐号动车组D字头列车23趟，C字头列车2趟，G字头列车11趟。

通过于都站可直接到达北京、上海市、深圳市、南京、福州市、武汉市、西安市、杭州市、南昌市、厦门市、成都市等国内大城市，极大方便了赣州市革命老区于都县各乡镇及周边县市人民的铁路出行。

2019年12月26日，昌赣高速铁路开通运营，于都县正式进入高铁时代。

于都火车站始建于2002年，2004年基本建成，2005年随赣龙铁路投入使用。为促进革命老区经济发展，2001年底赣龙铁路开工建设，于都火车站于2002年开工建设，并修建了站前广场、公交站台等配套设施。

随着赣龙复线、昌赣高铁的通车，于都站日益增加的客流量与站房基础设施落后之间的矛盾越发显现。为改善群众出行条件，在现有的基础上进行升级改造，建设标准为三等站。该项目总投资1.4亿元，总建筑面积13140.68平米，其中地下一层5618.99平米，地上一层3091.27平米，地上二层2610.92平米，夹层728.55平米，出屋面楼梯34平米，新建天桥401.87平米，新建雨棚469平米，新建入口、电梯186.08平米。

于都屏山牧场（4A）、长征第一渡（中央红军长征出发纪念馆）（4A）、罗田岩磨崖石刻、重光宝塔（宝塔公园）、雩山风景区、红峰、金溪湾度假村、禾丰兰花小镇等。

站前广场有通往于都县各乡镇的汽车，站前广场有公交车枢纽站及出租车停靠点。

于都火车站站前广场是于都公交公司的日常运行办公枢纽中心，公交公司在站前广场一楼设有办公室，可办理/充值公交卡，另于都公交支持刷赣州市一卡通。

以下是于都火车站站通往县城的公交路线：

1路：

火车站—工业园（芦山安置小区）

（首班：6：15末班21：00间隔约10分钟一班）

途经站点：火车站→站前小学→石陂桥→福熙城→实验二中→二中→马子口→国光一店→北门街口→中国银行→长征公园→工贸城→党校（汽车站）→贡江医院→三中→长征宾馆→广场西路→环卫所→兴乐路口→科技学校→西经路口→奥科特→工业园（芦山安置小区）

2路：

火车站—锦绣嘉园

（首班：6：20末班17：50间隔约20分钟一班）

途经站点：火车站→石陂桥→嘉怡花园→中医院→马子口→二中→水岸新城→汇金广场→起元巷→农贸市场→解放路口→三小→汽车站→三中→长征宾馆→明德小学→锦绣嘉园

6路：

火车站—汽车站

（首班：6：30末班17：30间隔约30分钟一班）

途经站点：火车站→特殊教育学校→五中→福麒山庄→锦绣嘉园→宝塔公园→明德小学→阳光水岸→汽车站

15路

火车站—罗田岩

（周日及国家法定节假日定点发车，两趟7：10及9：10）

途经站点：火车站→站前小学→石陂桥→福熙城→实验二中→水岸新城→长征第一渡→二中→马子口→国光一店→北门街口→中国银行→长征公园→工贸城→党校（汽车站）→长征大桥→新人民医院→罗田岩

汽车站均有发往到赣州市、南昌市、新余市、深圳、广州市、厦门市、石狮及周边县市汽车。

赣龙铁路复线项目（赣龙铁路扩能改造工程）是国家铁路网的重要组成部分，是江西省、福建省两省对外通道的主干线之一。位于江西省东南部、福建省西南部，线路西起江西省赣州市，东至龙岩市，途经江西省赣州市章贡区、赣县区、于都县、会昌县、瑞金市，福建龙岩市长汀县、连城县、上杭县、新罗区。线路西连赣州市，与京九铁路衔接；东接龙岩市，与龙厦、漳龙铁路接轨。

新建双线铁路正线全长272.832km，其中江西省境内136.677km，福建省境内136.155km。本次新建双线设赣县、于都、会昌北、瑞金、长汀南、冠豸山、古田会址、龙岩共8个车站，其中长汀南、古田会址站为新建车站，其余为利用既有车站。项目投资估算总额228.941亿元，于2010年9月开工，预计2015年全线铺通并投入运营。如今，于都县有往厦门市，福州市等沿海城市的动车组列，分别为：1.12月26日至1月9日福州南～赣州市增开D6971/4次，赣州～福州南增开D6973/2次。2．12月26日至1月9日赣州～厦门增开D6983次，厦门～赣州增开D6984次。3．12月26日至1月9日赣州～厦门增开D6981次，厦门～赣州增开D6982次。4.2015年12月26日至2016年1月4日福州—赣州增开D6975/8次，赣州—瑞金市增开D6991次，12月26日至1月5日赣州—福州增开D6977/6次，12月27日至1月5日瑞金—赣州增开D6992次。5.2016年1月5日至1月9日福州市—赣州市增开D6975/8次，赣州—瑞金增开D6991次，1月6日至1月9日赣州—福州增开D6977/6次，瑞金—赣州增开D6992次。