人芽囊原虫（Blastocystis hominis）是导致人类腹泻的重要机会致病原虫之一。人芽囊原虫主要寄生于人和其他
灵长目的
放射性肠炎内，也广泛寄生于猪、犬、猫、鼠、
家兔、蛙、蛇和家禽等多种动物的
消化道内。
人芽囊原虫形态多样，大小差异也较大，直径为4~63微米，多数为6~15微米。体外培养的人芽囊原虫可分为空泡型、颗粒型、
阿米巴虫型、复分裂型和
包囊型五种类型。其主要传染源为粪便中可排出人芽囊原虫的患者和
绦虫者，主要传播途径是粪—口传播。人体感染人芽囊原虫后多数为无症状带虫者，间歇性
腹泻为常见症状，可自愈；重症者表现为经常性腹泻，并伴有腹痛、腹胀、厌食等。
人芽囊原虫呈世界性分布，热带和亚热带地区高发，各地感染率不尽相同，截至2017年，
发达国家感染率在0.5%~10%，发展中国家人群感染率为30%~50%。
人芽囊原虫（Blastocystis hominis）广泛分布于世界各地。曾经长期被认为是一种对人体无害的酵母，近年来大量证据表明，该虫是
寄生在高等
灵长目和人类肠道内可致病的
原虫。有关其分类地位争论较久，曾先后被归入
孢子虫亚门(1967)和
肉足虫亚门、
阿米巴虫目、芽囊原虫
亚目(1988)。但是，许多学者对这种分类提出异议。
江静波、何建国(1993)提出该虫应属芽囊原虫新亚门（Blastocysta），芽囊原虫纲（Blastocystidea）、芽囊原虫目（Blastocystida）、芽囊原虫科（Blastocystidae）、芽囊原虫属（Blastocystis）。
该虫大小差异较大，直径4～63μm，多数为6～15μm，形态结构复杂，体外培养有空泡型、颗粒型、
阿米巴虫型和复分裂型4种类型虫体，粪便中常见为空泡型。光镜下碘染，空泡型虫体呈圆形，直径4～15μm，中央见透亮的大空泡。核呈月牙状或块状，核数1～4个不等。颗粒型虫体充满颗粒状物质，颗粒分为代谢颗粒、脂肪颗粒和繁殖颗粒3种，活体观察
阿米巴虫型虫体形似
溶组织内阿米巴滋养体，形态多变，体内有许多明显的小颗粒物质，移动极缓慢。复分裂型虫体，一个虫体分裂成3个、4个或更多。
人芽囊原虫生活史尚不完全清楚，有学者通过观察研究，认为其生活史为空泡型—
阿米巴虫型—空泡型。空泡型也可转变为颗粒型和复分裂型。阿米巴型是致病型虫体。其生殖方式包括：(1)二分裂；(2)空泡型虫体中心出现颗粒，转变为颗粒型虫体，虫体生殖颗粒发育成子
细胞；(3)内二
出芽生殖和(4)裂体增殖。