新四军第6师是抗日战争时期新四军的7个主力师之一，由原江南指挥部所属部队及
江南抗日义勇军等部合编而成。师长兼政委为谭震林，参谋长为罗忠毅，辖第16、第18旅。最初全师共8000余人。
1941年1月
皖南事变后，中共中央统一整编新四军时，将活动于苏南的江南指挥部所属部队及江南人民抗日救国军编为第6师。谭震林任师长兼政治委员，罗忠毅任参谋长。下辖第16、第18旅，共8000余人。同年3月，日伪军在太(湖)(湖)区发动“扫荡”，
中国国民党忠义救国军乘机进袭，第16旅歼日伪军200余人，消灭“忠救军”一部。5月，在
溧阳市西北黄金山，击溃国民党顽固派军队3次进攻，恢复了阳、
溧水区、
江宁区、
句容市根据地。7月，日伪军 1.5万余人对苏州、常熟、太仓地区实施“清乡”，第18旅主力在进行反“清乡”战斗后，于8月下旬开始北渡
长江，10月到达江都、高邮、宝应地区，执行开辟建设抗日根据地任务。11月划归第1师建制。同月，日伪军3000余人“扫荡”溧阳地区，第16旅旅部在溧阳县塘马被围，经激战后，一部突围，兼旅长罗忠毅和旅政治委员廖海涛等200余人牺牲。
1942年春，重整第16旅旅部，继续坚持以
茅山为中心的抗日根据地。7月，击退
中国国民党顽军的进攻。11月，中共中央军委决定第6师师部与第1师师部合并，对外仍保留第 6师番号。年底，苏中第1师第2旅旅部率主力渡
长江南下，与第16旅合编，仍称第16旅。1943年4月，国民党顽军向
溧阳市、
溧水区地区进攻，第16旅被迫自卫还击。10月，日军向苏浙皖边发动进攻，国民党军不战而退；第16旅尾击日军，收复溧阳、溧水、
长兴县、
广德市、
郎溪县、
宣城市等县广大地区，扩大了苏南抗日民主根据地。
1944年7～10月，第16旅攻克长兴地区日伪军据点10余处，挺进到南京市郊陆郎桥。12月，克长兴以西重镇泗安。1945年1月成立苏浙军区后，第16旅改为苏浙军区第1纵队，参加浙西天目山自卫反击战。到大反攻前，第1纵队主力发展至8000余人。大反攻中收复
金坛区、
溧阳市、
溧水区、
高淳区、
宜兴市、郎溪、广德、长兴、安吉等县城及广大地区。10月，第 1纵队奉命北撤至苏中，编为华中野战军第 6纵队，参加
解放战争。
第6师在抗日战争中，坚持苏南敌后，斗争艰苦，战斗频繁，共歼日伪军1.6万余人，对钳制、打击南京、上海、杭州三角地区的日伪军，屏障苏北抗日民主根据地，起了重要作用。