至清康熙四十四年（1705），为备康熙南巡，巡抚赵申乔将寺改建为行宫，后圣驾南巡未果，五十三年（1714），巡抚王之枢奏请改行宫为“祝圣寺”获准；雍正、乾隆、爱新觉罗·颙琰年间均有修警；现存建筑为光绪六年（1880）重修，并增建罗汉堂等。其余4进殿堂，均面阔5间，前后出廊，廊柱有石、木2种，置格扇门；天王殿、说法堂盖金黄琉璃瓦，大雄宝殿、方丈室盖小青瓦。 1994年，新建照壁干山门前对街石阶上，并增建观音阁于天王殿西侧。

祝圣寺位于南岳镇东街中段。据清《南岳志》载：“禹礼舜建清冷宫于此。”唐天宝（742～756）初，僧承远在此建寺，名弥陀台；乾元间（758～760）增建精舍，曰般舟台；大历末年（779），李豫赐名“般舟道场”；贞元间（785～805），德宗赐名“弥陀寺”；会昌五年（845），李炎诏毁佛寺，寺废。五代十国时楚王马殷（896～929）又在故址重建，易名报国寺；北宋太平兴国间（976～984），赵光义赐额“胜业寺”；熙宁间（1068～1077）增建御书阁；政和间（1111～1118）一度为道观，名神霄宫；建炎间（1127～1130）复为寺，名胜业。明代复经重修，并增置寺产。至清康熙四十四年（1705），为备康熙南巡，巡抚赵申乔将寺改建为行宫，后圣驾南巡未果，五十三年（1714），巡抚王之枢奏请改行宫为“祝圣寺”获准；雍正、乾隆、爱新觉罗·颙琰年间均有修警；现存建筑为光绪六年（1880）重修，并增建罗汉堂等。祝圣寺占地逾30000平方米，有大小殿堂房舍200余间，建筑面积达14000余平方米，规模居南岳佛教五大丛林之首。座北朝南，砖木结构，单檐硬山顶，山面出偏头。中轴线上由南至北依次为山门、天王殿、大雄宝殿、说法堂（楼为藏经阁）、方丈室。山门为三拱门楼阁式牌坊，黄色琉璃瓦盖顶，彩色泥塑饰面，正门竖额书“祝圣寺”；山门前有月台，围以石栏，月台前施石质踏跺。其余4进殿堂，均面阔5间，前后出廊，廊柱有石、木2种，置格扇门；天王殿、说法堂盖金黄琉璃瓦，大雄宝殿、方丈室盖小青瓦。中轴线两侧，祖堂、禅堂、药师殿、罗汉堂、知客厅、香积厨、库房、斋堂等环列两厢，以廊相连；两厢外侧为二层家房，一列数十间。1994年，新建照壁干山门前对街石阶上，并增建观音阁于天王殿西侧。1956年7月、1972年9月和1983年10月，祝圣寺均被公布为省级文物保护单位；1983年4月9日，国务院将其列为全国汉族地区佛教对外开放场所。