被孢小多孢菌是一种真菌，其特征为气丝和基丝均无隔，直径分别为0.4—0.8微米和0.6—1.1微米。这两种丝都能产生孢子，气生孢子单个或2—15个成短链，形态多样，包括直、勾、环状或螺旋形，长6—10微米。孢子链常常盘卷成形状和大小不规则的孢子团，4—10×2.5微米，有时两链合在一起。孢链小柄长0.7—1.1微米。

气生孢子单个或2—15个成短链，直、勾、环状或螺旋形，长6—10微米，时常盘卷成形状和大小不规则的孢子团，4—10×2.5微米，有时两链合在一起。孢链小柄长 0.7—1.1微米。

基丝上孢子较葡糖硝酸盐琼脂：无气丝。基丝丰茂，菌落略隆起，直径 2—3毫米，乳脂色。

淀粉硝酸盐琼脂：无气丝。基丝好；色。

葡糖天冬素琼脂、淀粉铵盐琼脂：无气丝。基丝少，菌落直径1—2毫米，淡黄色。

肉汤蛋白琼脂：无气丝。基丝丰茂，多皱，乳脂色。

高氏有机2号琼脂：无气丝。基丝好，菌落1—3毫米，无色。

大豆粉葡萄糖琼脂：气丝白色。基丝丰茂，菌落直径3—5毫米，隆起，暗肉色。

燕麦粉琼脂：气丝粉状，白色。基丝丰茂，菌落直径5— 8毫米，乳脂色，后暗肉色。

马铃薯琼脂：无气丝。基丝好，沙色。明胶液化。牛奶胨化。纤维素上不长。硝酸盐还原。不产生类黑色素和硫化氢。生长适温27℃；21℃和37℃生长好但无气丝；48℃不生长。在D-葡萄糖、L-阿拉伯糖、蔗糖、 D-甘露醇上生长好；在D-木糖、果糖上生长弱。在L-鼠李糖、棉子糖、肌醇上不生长。抑制革兰氏阳性细菌、放线菌。