磨憨站是玉磨铁路最大的车站，位于勐腊县磨憨镇尚勇村，距镇中心约1公里，建成后，将成为中老国际铁路货运和客运大型编组站。根据中国铁路经济规划研究院新建玉磨铁路磨憨站建筑概念设计方案征集信息公告，磨憨站车场规模为2台9线，站房综合楼建筑面积为10000平方米。

磨憨站长约3500米，宽约400米，总占地面积190多万平方米。车站设有国内和国际列车到发线，是中老国际铁路进出我国的第一站，也是今后中老昆万铁路货运和客运大型编组站。

磨憨站沿线附近有小磨高速公路，交通方便，地形平缓开阔。火车站站场路基正线长度3176米，平均填高8米，占地面积2464亩，预计2018年7月31日建成。

磨憨火车站为单线会让站，设有旅客双向进出站通道，主站房设在靠近正线右侧，磨憨火车站设于正线上，规划总规模共计17条到发线，预留线10条。其中，一个国内客运场设有两台5线，预留两线，一个国内货车到发场设有6线，预留8线，一个调车场设有3线，一个国际货物列车监管区设有1线，一个临时物资储备场设有两线，一个国内货物列车货物场设有3线，一个机务段设有4线，预留两线。

2017年2月，磨憨站施工进度顺利，正在组织大规模的站场软基填高处理及土石方施工，确保在2019年6月左右投入正常使用。

2017年3月13日，“三级委员”视察玉磨铁路磨憨站施工现场。

2017年6月，中老边境磨憨经济开发区内的磨憨客运站工地，已经进入了路基填筑的施工阶段，长约30公里的腊车站路基表层填筑即将完成，而临近磨憨客运站的尚岗1号隧道，已经开挖掘进1000多米，预计将于2019年贯通。

2017年8月7日至8日，西双版纳傣族自治州重点建设项目现场推进会在勐腊县召开。参会人员实地察看了玉磨铁路磨憨站等建设项目，现场研究解决建设过程中面临的困难和问题。

2017年8月10日至15日，云南省社会科学院副院长边明社率课题组赴西双版纳州就“中老磨憨—磨丁经济合作区建设”情况进行专题调研。调研组一行到玉磨铁路项目磨憨区段站等项目地进行实地调研，并现场听取了各部门的情况介绍。

磨憨镇站是玉磨铁路第二大车站，该站建成后，将直接连通中老两国，打通中老交通制约瓶颈，具有极大的政治和经济意义，对拉动勐腊县（磨憨）重点开发开放试验区以及全州的经济发展将起到极大的促进作用。

玉磨铁路从昆玉铁路的玉溪市站起至中老(挝)边境磨憨，设13个中间站，从北到南分别为玉溪站、研和站、峨山站、罗里站、元江站、墨江站、宁洱站、普洱站、勐养镇站、西双版纳站、橄榄坝站、勐腊站和磨憨站。