层菌纲（Hymenomycetes），层菌纲真菌大多数为腐生菌，许多有食用和药用价值及引起木材腐朽的大型真菌都属于此纲。层菌纲的担子果一般都相当发达，典型裸果式或半被果式。质地有胶质、蜡质、革质、木栓质或肉质，形态多种多样。担子有横隔或纵隔，或是无隔单细胞。根据担子有无隔膜，分为：有隔担子菌门亚纲（Phragmobasidiomycetidae）、同担子菌亚纲（Holobasidiomycetidae），共包含9个目，约8000多种。

层菌纲，担子菌亚门的 1纲。本纲真菌担子果通常发育良好，子实层由一堆平行排列的担子及其他不孕结构（如囊状体等）组成，在担子果或子实体成熟前或成熟后暴露于外。担孢子成熟后，自动地从担子上掷射出去。

层菌纲（hymenomycetes) 真菌的担子果一般为相当发达的大型担子果，裸果型或半裸果型，担子形成子实层。担孢子成熟后可以强力弹射。大多为腐生，有许多可以引起木材腐朽，少数可以为害植物，有的是森林植物的重要病原菌。本纲真菌有的为食用菌，如蘑菇、木耳等；有的可作药用，如野生黑芝等。近年来发现有不少种类含有抗癌物质，有少数是毒菌，人畜食用可产生幻觉或致死；有的是与植物共生的菌根菌。层菌纲真菌与农作物病害的关系较小，只有少数是农作物的病原菌。

依据担子有无分隔，本纲下分2亚纲：担子有横隔或纵隔的为有隔担子菌门亚纲，属于这一亚纲的有银耳目、木耳目和隔担菌目。担子没有隔膜的为同担子菌亚纲，包括外担菌目、座担菌目、花耳目、胶膜菌目、多孔菌目和蘑菇目。共9目约750属，其中包括不少有食用价值和药用价值的大型真菌，还有一些是有毒的菌类。少数种类与植物或昆虫共生。

Ainsworth(1973)采纳（Talbot的分类意见，根据担子有、无隔膜，将层菌纲分为有隔担子菌亚纲和无隔担子菌亚纲，共包含9个目，675属，约5000种。

（一）有隔担子菌门亚纲（Phrahmobasidiomycetidae) 有隔担子菌亚门纲形成有隔担子，分银耳目、木耳目和隔担菌目3个目。

银耳目( Tremellales )真菌都是木材上的腐生菌，少数寄生在真菌上，担子裸果型，大多为胶质。典型的担子以十字型纵隔分成4个细胞。银耳( Tremella fuciformis )是其中很典型的种。

木耳目( Auriculariales )真菌大都为木材上的腐生菌，少数寄生真菌上。担子 果为裸果型，大多为胶质，干后呈坚硬的壳状或垫状。子实层分布在担子果表面。典型的担子有横隔分为4个细胞。常见的寄生菌是为害桑和其他树木地下部引起纹羽病的桑卷担菌( Helicobasidium mompa)和紫卷担菌( H.purpureum)。它们的担子果不发达，担子卷旋。毛木耳(Auriclaria polytricha )是中国在麻栎等木材上栽培的食用菌。

隔担菌目 (Septobasidiales ) 隔担菌目是—类很待殊的真菌，大都是为害植物的介壳虫上的共生菌。担子果不很发达，原担子的壁很厚(有些像冬孢菌纲真菌的冬孢子)，异担子则横隔为4个细胞，小梗上着生担孢子。这一目真菌中有少数是植物病原真菌，如引起桑膏药病的柄隔担耳 ( Septobasidium pedicellatum ) 和柑橘属膏药病的柑桔生隔担耳( Septobasidium citricolum )。

（二）同担子菌亚纲（Holobasidiomycetidae）无隔担子菌亚纲真菌形成无隔担子、分外担菌目、座担菌目、花耳目、胶膜菌目、非褶菌目和蘑菇目（蘑菇目）6个目。

外担菌目(Exobasidiales ) 外担菌目真菌都是维管植物上的寄生菌，为害茎叶引起叶斑和肿瘤等畸形。它们无担子果，担子在受害部的表面形成子实层，在许多方面与子囊菌门中外囊菌属( Taphrina )真菌相似。本目真菌种类不多，约含5个属。外担菌属(Exobasidium )是最重要的属，其中的许多种可为害山茶属、石楠科、樟科等常绿木本植物，引起茶饼病的坏损外担菌( Exobasidium vexans )是常见的种。

座担菌目（Brachybasidiales）座担菌目真菌的担子疱状或盘状。担子细长，成簇地从叶片下面的气孔伸出，棍棒形或近梨形，由上担子和下担子组成，二者之间有明显缢缩。上担子顶端有2个小梗，每个小梗上各生一个担孢子。本目仅有一科，2属。重要属为座担菌属（Brachybasidium）。座担菌（B.pinangae)寄生于山槟囊属（Pinangin)植物上，引起叶斑病。

花耳目（Dacrymycetales) 花耳目真菌的担子果小，胶质，垫状、瓣状或匙状，无柄或有柄，颜色鲜艳，黄色或橘黄色。担子圆柱形或棍棒形，单胞，顶端分叉成两个粗壮的小梗，呈音叉状。每一小梗上各生一个担孢子。常见的有花耳属（Dacrymyces)黄花耳（D.aurantius)，腐生于朽木上。

胶膜菌目( Tulasnellales ) 胶膜菌目真菌形成铺展在基质表面的胶质状、粉状和蛛网状的担子果。担子果有白色、褐色、灰色、粉红色等。其中有腐生的和寄生的。寄生的主要是为害植物靠近上面的部分，有些是兰科上的菌根真菌。特别值得提出的是亡革菌属(Thanatephorus )中的瓜亡革菌(T.cucumeris )，是寄主范围很广的病原 菌，为半知菌立枯丝核菌( Rhizoctonia solani )的有性 态。

非褶菌目(Aphyllophorales ) 非褶菌目真菌一般形成较大的裸果型担子果，包含的种类多，已知1200多种。担子果有紧贴平展状或平展反卷状、菌盖状、小杯状或盘状，也有棍棒状和分枝成珊瑚状的，担子果有柄或无柄，担子果中着生子实层的部分(子实层体)有平滑、齿状、棍棒状和管状的。担子果的质地为革质、木质或木栓质，一般都比较坚实，少数肉质，有的可食用，如猬状猴头菌、鸡油菌等。非褶菌目真菌大都是枯树、木材和腐殖质上的腐生菌，也有少数是植物病原真菌，如引起茶树、橡胶树和其他热带植物根部紫腐病的鲑状伏革菌( Corticium salmonicolor )；引起多种果树银叶病的紫韧革菌( Stereum purpurem )；引起茶树、咖啡、可可、橡胶等根腐病的橡胶树灵芝( 灵芝属 pseudoferrem )等。总的来说，非褶菌目中的病原真菌主要为害木本植物，大都是先为害根部。非褶菌目中有些是药用真菌，如灵芝( Ganoderma spp.)等。

蘑菇目(Agaricales ) 蘑菇目真菌的担子果是肉质的，为半被果型，典型的为伞状，由菌盖和菌柄两部分组成。子实层着生在菌盖下面的菌褶上。少数蘑菇目真菌的子实层体呈孔状，如牛肝菌属(Boletus )中的食用菌。蘑菇目真菌大都是树枝、木材、腐殖质或粪堆上的腐生菌，少数可引起树木和果树的根腐病，其中最主要的是蜜环菌(Armillaria mellea )。我国著名药材天麻，就是蜜环菌和一种兰科共生形成的。蘑菇目中有很多是食用菌，大量栽培的是蘑菇(Agaricus campestris )。少数蘑菇有毒，通常称为毒伞菌或毒蘑菇。毒伞菌的待征是菌盖肉质，帽形，容易腐烂，菌柄生于菌盖中央，与菌盖容易分离；担孢子无色或粉红色，菌柄基部有菌托，为担子果包被开裂后的残留物，菌柄上有菌环。常见的种是毒伞属(鹅膏属)中的毒伞(A.phalloides )，又称鹅膏菌，在食用蘑菇引起的中毒中，绝大多数是因误食此菌引起的。