军机章京俗称“小军机”，早期也称为“司员”。最初，
章京无一定额数，在
内阁中书等官员中选调。
乾隆初，改由
内阁、各部、
四夷馆等衙门调派。
自
爱新觉罗·颙琰四年（1799年）始，定军机章京分满、汉各两班，每班8人，共32人。各班设领班、帮领班章京各1员，由军机大臣于章京中选资深望重者任之。
军机章京的选任，据《枢恒纪略》卷7载：“汉军机章京由内阁中书、六部郎中、
员外郎、
主事、七品小京官由
进士、
举人出身者兼充；满军机章京以内阁中书、六部、理藩院郎中、员外郎、主事、
笔帖式兼充”。光绪三十二年（公元1906年）确定汉章京额缺为20人。
军机章京也是兼差，凡承旨入值军机处的官员，仍为原衙门的实缺并照例升转。军机
章京一般为五、六品，领班章京为从三品或
正四品。军机章京按例不参加
京察，其奖叙升转由军机大臣酌情保奏，平时每届三年奏保，凡遇修补档案，
编修方略等事结束时，均照例特保，故章京的提升较快，当时人视之为升官的捷径。光绪三十二年（公元1906年）十二月初十日奏定变通军机章京升补章程，定军机章京为实缺，其领班章京秩视三品，帮领班章京秩视四品，以下各章京俱按原品实授。并规定了三年递升一级的升补办法①。军机章京办理军机处的日常工作，处理文书，记注档册，撰拟文稿等。自
乾隆时
富察·傅恒任领班军机大臣始，军机章京亦同时负撰拟谕旨之责；还参预军机处新承办案件之审理；跟随军机大臣或单独奉派往各省查办和处理政务。
乾隆年间入直：阿尔布、灵宝、
硕善、定福、书秀、
温福、
三宝、官登、德克进、敏德、常亮、安福、德舒、德勒炳阿、巴颜他哈、乌勒穆集、图桑阿、萨壁、灵、富察善、雅河图、福德、
傅显、
鄂宝、
巴延三、
富德、阿固哩、景宣、唐乌里、九格、
富明安、额勒登额、辅德、武保、索琳、文禄、立柱、
博清额、博昆、赫泰、本珠克、额尔景额、本忠、明山、富森布、庆桂、东文、沙勤、明德、富传、
珠鲁讷、巴尼珲、额腾额、
郝硕、巴清额、
明福、什蒙额、德敏、苏灵额、赛明阿、
西凌阿、留保住、昌峻、福宁、
富察·明瑞、诺穆清、德成、舒彬、法福哩、勒保、玉山、伊克坦布、英善、毓奇、成策、特升额、宜绵、惠龄、兴隆、盛住、穆精额、明书、海宁、永保、那丹珠、福禄、苏成额、
穆克登、特克慎、保成、
福崧、奎舒、璧兴、庆彰、
齐布森、明伦、舒林、阿扬阿、佛喜保、庆玉、
伊江阿、靖海、吉尔喀拉图、索住、高杞、齐慎、奇格、库奇克泰、福尼善、敷伦泰、海广、阿林、苏楞泰、那琅阿、玉华、五岱、舒弼、克昌、塔琦、博兴、达桑阿、
长龄、
松筠、萨哈善、舒廉、达春、策拔克、贡楚克札布、索宁安、德纶、托津、索明阿、
嵩贵、
富俊、
台斐音、巴忠、成林、海升、衡龄、恩长、札克桑阿、札拉桑阿、珠尔赓额、台布、穗克精阿、法克津、图璧赫、福成额、海成、诚麟、湛露、萨荣安、巴克坦、素讷、全保、常明、鄂勒锡叶图、苏明阿、索凌阿、长亮、索恩、文孚、巴哈布、玉凝、景敏、文宁、和太、富察善、员承宁、图勒炳阿、吉隆阿、珠尔松额、德丰、珠拉、明安泰。
爱新觉罗·颙琰年间入直：
遇昌、和精额、多容安、鄂灵、明舒、德克津布、
福绵镇、伊星阿、
叶赫那拉·瑞麟、伊诚额、吉祥、武尔通阿、金齐贤阿、锡龄、兴科、昌宜泰、穆馨阿、廉敬、祥麟、吉郎阿、重伦、
花连布、伊博格图、克兴额、珠满、诚端、成贵、玉彰、
景昌、企善、昌炽、诚安、成善、那丹珠、札勒杭阿、容海、岳龄安、廷勋、安诚、桂明、瑞庆、桂芬、福兆、阿成、福升阿、阿达顺、
乌尔恭额。
爱新觉罗·旻宁年间入直：德舒、福英阿、苏勒芳阿、三龙泰、
阿鲁特·赛尚阿、
平庆、文明、岳龄、
赫舍里·英桂、玉昆、那逊阿古拉、松林、达兴阿、英麟、春和、文俊、惠麟、文丕、熙成、桂德、阿龄阿、音德贺、英干、玉春、文斌、德云、庆安、瑞春、麟翔、
崇纶、福连、爱升图、崇光、豫庆、清泰、
云锦、诚廉、恩符、文裕、海庆、麟椿、崇祥、崇泰、春长、麟书、
托和络·穆荫、绍德、四庆、济安、苏勒芳阿、福善、
丰盛额、清盛、托克托布赛音博勒格图、西朗阿、德椿、英秀、瑞亨、衡光、赛沙布、嵩寿、桂昌、文彬、宝福、文吉、达春布、庆安。
咸丰年间入直：长年、庆霖、苏布、玉衡、文衡、英祥、钟秀、祥保、崇缮、松龄、
英廉、兴昌、裕彰、塔克什布、增寿、瑞廉、庆多、
庆裕、奎绶、昆玉、额图珲、英谦、文海。
同治年间入直：
续昌、额哲克、裕长、容斌、本贵、三德、春、尚德、五春、志文、丰绅泰、增林、
文绶、文龄、额勒精额、如松、文英。
乾隆入直：潘中立、
涂逢震、孙绍基、胡宝琼、
方观承、
蒋元益、王恺伯、
张泰开、
梁国治欧阳正焕、何曰熙、王贻桂、袁芳松、钱、胡廷枢、沈作朋、杨承曾、
庄培因、
曹锡宝、毛永、陈朝础、眭朝栋、程焘、
孔继汾、程岩、申甫、王以、孙梦逵、
袁守侗、
冯光熊、章宝传、顾云、
王日杏、张三宾、梅立本、毛应藻、
蒋宗海、
陈辉祖、
刘湘、
赵翼、
毕沅、陆耀、张霁、金云槐、张若淳、
童凤三、贺五瑞、诸重光、丁？焘、
刘秉恬、王昶、
汪承霈、熊学骥、袁匡肃、钱受谷、
赵文哲、
阮葵生、
陆锡熊、
郑步云、
陈绳祖、王友亮、
陈希哲、
冯应榴、徐步云、
刘谨之、
严长明、王嵩柱、洪朴、吴寿昌、周发春、
费淳、金榜、
金光悌、
潘庭筠、
孙永清、陆、王彝宪、邵洪、蒋熊昌、
姚梁、沈启震、王庆长、史梦琦、
汪日章、龚提身、
吴锡龄、程维岳、冯培、杜兆基、沈清藻、
吴熊光、
方维甸、范、
戴衢亨、吴俊、施光辂、
裘行简、
关槐、蒋谢庭、赵辉、正学海、
胡时显、章煦、毛上、盛悼崇、张姚成、张敦培、张曾效、毛凤仪、秦瀛、沈琨、
赵秉渊、洪梧、
汪彦博、金应琦、
张师诚、
管世铭、
程振甲、柴模、孙衡、
费锡章、鲍勋茂、
钱楷、
曾燠、杨、杨世纶、
钱沣、
姚祖同、曹德华、陈庆槐、何金、黄文辉。
爱新觉罗·颙琰年间入直：齐嘉绍、
姚文田、
傅淦、赵佩湘、胡枚、
吴光悦、颜允璨、蔡炯、茅豫、任垣、何元娘、
糜奇瑜、
熊方受、
张志绪、黄跃之、杨恬、盛悼大、袁煦、万云、
卢荫溥、
叶继雯、吴应咸、
龚丽正、
康绍镛、
张树侯、童槐、梁承福、王厚庆、王风翰、余元、程同文、聂镜敏、
赵盛奎、秦绳曾、陈钟鳞、杨振麟、陆、吴书城、吴颐、
张允垂、韩文显、孙兰枝、徐、
吴孝铭、
苏兆登、
何增元、闻人熙、沈学廉、
赵光禄、程雷采、徐受荃、
吴荣光、强逢泰、李昌平、
梁章钜、路德、钱廷熊、陈彬、
许乃普、
乔用迁、佘文。
爱新觉罗·旻宁年间入直：胡方朔、王启文、陈孝宽、蒋泰阶、马光澜、
李彦章、俞诵芬、
傅绳勋、蔡勋、
赵荣、朱逵吉、
张祥河、
龙汝言、周涛、
汪元爵、徐思荃、方铭彝、郑乔林、
许球、
何汝霖 王藻、徐？基、
汤鹏、郑瑞麒、
万贡珍、
王广业、
程庭桂、
陈孚恩、江绍僖、
彭蕴章 朱应元、刘？昌、王寅、马丽文、王积顺、
林扬祖、胡增瑞、陈本钦、
吴清皋、何桂馨、江鸿升、
潘铎、
王桂、
颜以燠、汪本铨、
乔晋芳、吴光业、
宗稷辰、涤梁瀚、
程恭寿、庄心省、朱宪曾、朱丽宣、
袁甲三、吴士、钟启峋、
吴福年、林映棠、王发桂、
邵懿辰、刘子城、王本梧、文岳英、吴嘉淦、
曹毓瑛、汪、
段晴川、蒋锡绶、胡嘉楷、毕至、陈鸿、
丁守存、
胡家玉。
咸丰年间入直：钱宝青、吴台朗、钱以同、李汝、
林寿图、程祖、
吴兆麟、
贺寿慈、邓廷丹、
张金鉴、李德、段承实、梁经先、
郭祥瑞、裴季芳、
白恩佑、章标、曾协均、
王拯、郑锡瀛、洗斌、夏献云、谢谦亨、蒋超伯、康锡龄、朱梦元、
方鼎锐、
朱学勤、朱智、张德容、靳邦庆、
许庚身、蒋继洙、蔡兆槐、杜来锡、王恩炳、钱应溥、范运鹏、龚聘英、
沈淮、
江人镜、李庭萧、周瑞清、何入之、区公辅。
同治年间入直：龚嘉俊、陈元楷、王汝讷、冯柏年、
徐用仪、史秀、邵文煦、徐景轼、方熊祥、
叶衍兰、萧庭滋、吴国杰、金曰修、梁僧宝、胡延夔、陆？棠、张岳年、李耀奎、李方豫、
李士彬、
丁鹤年、
沈源深、
魏邦翰、陈毓秀、冯光勋、李固恒。