藤野严九郎（1874年7月1日-1945年8月10日），出生于敦贺县　(现福井县芦原町下番)，毕业于爱知县立医学校（现为名古屋大学医学部），藤野家第六代医生，仙台医学专门学校解剖学教授，鲁迅留学日本时的老师。

藤野严九郎从爱知县立医学校毕业后，去了学校的解剖教研室，从助手升到助教谕。期间，他还去东京大学医学部进修。1903年到1915年期间，藤野在仙台医专任解剖学教授。1915年，41岁的藤野严九郎因为没有留学经历而失业。之后，他尝试去别的学校找教授职务，但均被拒绝。1918年，藤野严九郎回到岳父所住地区，自立诊所。最初，藤野是帮助二哥明二郎给人看病。一年后，二哥猝死，藤野严九郎便回到下番继承了二哥的事业。此后藤野在下番行医达十数年。1945年8月11日，藤野严九郎因年迈体衰而去世，终年七十一岁。

藤野严九郎对解剖学、骨学、血管学、神经学等较为精通，亦有行医资格。1937年中日战争爆发，受战争影响，藤野从不向那些贫困的病人收取诊疗费，大部分患者送来的礼物也被他退还。

藤野严九郎，1874年7月1日出生于敦贺县　(现福井县芦原町下番)，祖上从江户时代初期开始，就在该地开业做医生。藤野的祖父与父亲以学习研究“兰学”著称。到了上学的年龄后，藤野严九郎进入丸冈町的平章小学读书。由于当时日本的初等教育制度还不完善，藤野便在私塾接受汉学与练字、算盘的教育。但仅在私塾学习而不学英语与自然科学，便不能成为医生，因此，藤野严九郎又去三国町的龙翔小学(现三国南小学)读书。小学毕业后，藤野严九郎到福井县寻常中学读书，二年级一结束，他就进了名古屋市的爱知县立医学校。

从爱知县立医学校毕业后，藤野严九郎留校任教，1897年获得行医资格后又到东京帝国大学学习解剖。1901年10月，其应聘到仙台医学专门学校任解剖学讲师，于1904年升任教授。此后，藤野严便一直在仙台医学专门学校任教。

1915年，仙台医专并入东北帝国大学，41岁的藤野严九郎因为没有留学经历而失业。之后，他尝试去别的学校找教授职务，但均被拒绝。无奈之下，藤野去东京进修临床外科，学习行医。结业后，其进了东京的一家慈善医院做医生，但很快便又失业。

1918年，藤野严九郎回到岳父所住地区，自立诊所。最初，藤野是帮助二哥明二郎给人看病。同时，在三国町开了耳鼻科诊所。一年后，二哥明二郎猝死，藤野严九郎便回到下番继承了二哥的事业。此后藤野在下番行医达十数年，很受村民们的认可。

 1945年8月10日，藤野严九郎在前往好友土田家的途中，突然晕眩倒地。8月11日上午十点，藤野严九郎因年迈体衰而去世，终年七十一岁。

1904年9月13日，去日本留学的鲁迅在东北大学的阶梯教室与时任解剖学教授藤野初次相遇。藤野讲课时带有家乡福井县的口音，而鲁迅是在东京学习日语的，所以听上去虽然有些不习惯，但却觉得很亲切。留学期间，藤野主动要求鲁迅提交课堂笔记，并帮他认真批改，悉心指导，两人师生情谊便由此开始。

后来，在一次课堂中，鲁迅受课程的影响，决定弃医从文。当他向藤野提出要从仙台医专退学时，被问到原因，鲁迅只说想去学习生物学，由此藤野对他很是失望。但两人分别时，藤野还是赠给了鲁迅一张照片，并在背面写着：“惜别　藤野　谨呈周君”。

1935年，藤野严九郎的儿子藤野恒弥在读高中时，其老师菅好春老先生交给恒弥一本书，说：“这本新出的书，是中国大文学家鲁迅先生的散文集，里面有一篇写的人叫藤野严九郎，跟你父亲的名字一样。你拿回去问问你父亲是不是他。当恒弥将书拿回家交给藤野，藤野用放大镜再三审视鲁迅照片后，肯定地说此人就是“周树人君”。年底，鲁迅的朋友小林茂雄找到藤野后，藤野这才知道，鲁迅不只把他的照片挂在墙上，把他写进散文里，这些年还一直在找他，想见他一面，哪怕能见他的后人一面。藤野追悔莫及。然后，日本记者向藤野先生约稿，他写了一篇短文《谨忆周树人君》，发表在日本的报纸上。次年10月鲁迅病故，藤野回忆了与鲁迅的交往，这就是悼文《谨记周树人君》的来历。

藤野严九郎去世后，家乡福井市于1961年为他建立了纪念碑。

1964年，为了纪念藤野与鲁迅结下的友谊，藤野的家乡福井县建立了“藤野严九郎碑”。

1983年5月18日，鲁迅的故乡绍兴市和藤野的故乡芦原町（现芦原市）结成友好城市。

1984年7月，藤野严九郎的故居被改造成藤野严九郎纪念馆。他生前任教的东北大学（仙台）(原名东北帝国大学)设立了“东北大学藤野先生奖”。

2006年，为纪念藤野严九郎与鲁迅惜别100年，北京鲁迅博物馆与藤野先生故乡日本福井县芦原市政府商定，互赠两先生铜像，分别立于芦原市、东北大学和鲁迅博物馆。为配合铜像揭幕典礼，芦原市和东北大学联合编辑了《惜别百年——藤野先生与鲁迅》一书，由东北大学出版社正式出版。

2009年，在鲁迅写下《藤野先生》的厦门大学，鲁迅的长孙周令飞与藤野严九郎的孙子藤野幸弥的手也紧紧握在了一起。

2017年内山书店100周年之际，在上海举办了纪念活动。在上海内山书店旧址前，内山完造的侄子内山篱与鲁迅的长孙周令飞的历史性握手。

藤野严九郎确实如鲁迅写的那样，穿衣服马虎，专业上却极其认真。教书多年的他，脾气直而且死板，非常不擅长接待病人。（沈丘县人民政府评）

藤野严九郎喜欢抽“朝日”牌香烟，喜欢下围棋。虽然不太擅长人际交往，但他不收穷人的诊疗费。他不欺骗病人，如觉得自己处理不了，就会主动介绍给其他医生一起会诊。（萍田忠兵卫评）