安徽农业大学动物科技学院的前身是安徽农业大学畜牧兽医系，始建于1958年。1994年畜牧兽医系改为畜牧水产学院，2004年更名为动物科技学院。学院学科门类齐全，学科结构合理，现设有动物科学系、兽医学系和水产养殖系；有动物科学、动物医学、水产养殖等三个本科专业，其中动物科学专业为“国家综合改革试点”专业、动物医学专业为“国家特色示范专业”和“安徽省高水平大学建设”专业、水产养殖学专业为“安徽省综合改革试点”专业。学院现有本科生1033人，研究生295人。

截至2020年5月，学院设有本科专业3个，拥有博士后流动站1个、一级学科博士点1个、二级学科博士点2个、一级学科硕士点3个、二级学科硕士点7个、专业硕士学位类别1个、专业硕士学位领域1个；有教职工94人，其中教授27名，副教授34名。

1958年9月，安徽农业大学农学系设立畜牧兽医学专业，并于当年招收兽医专业学生。同年，畜牧兽医系师生到安徽桐城舌河公社参加“拜农民为师”运动。

1959年9月，经当时省委批准，独立成立畜牧兽医系，下设畜牧、兽医两个专业，并当年招收畜牧专业学生。

1961年6月，经当时省委农村工作部批复，畜牧兽医系更名为牧医系；9月，经当时省教育厅调整，重新更名为畜牧兽医系。

1964年，畜牧兽医系师生到安徽寿县三觉区余积公社参加“四清”运动。

1965年4月，畜牧兽医系整体迁往凤阳县与凤阳农业学校合并；10月，根据当时省农业厅的要求，畜牧专业和兽医学专业合并为畜牧兽医一个专业。

1978年2月，经当时省教育局同意，畜牧兽医专业又重新分设畜牧、兽医两个专业。

1980年10月，经省高教局同意设立兽医卫生检验专业并当年招生，学制4年。

1981年2月，牧医系从凤阳迁回合肥市。

1985年4月，经省教育厅批准，设立淡水养殖专业（专科，2年）、动物营养与饲料（专科，2年）并当年招生。

1994年4月，经省教委同意，成立畜牧水产学院，兽医卫生检验专业（专科）停止招生，成立水产系，同时淡水养殖专业升为本科招生。

1995年5月，经学校同意，畜牧水产学院成立动物科学系、动物医学系和水产系三个系。

2004年，畜牧水产学院更名为动物科技学院。

截至2020年5月，学院设有动物科学、兽医学、水产养殖学3个本科专业。

截至2020年5月，学院有博士后流动站1个、一级学科博士点1个、二级学科博士点2个、一级学科硕士点3个、二级学科硕士点7个、专业硕士学位类别1个、专业硕士学位领域1个，有安徽省A类重点学科1个、安徽省B类重点学科2个。

博士后流动站：畜牧学

一级学科博士点：畜牧学

二级学科博士点：动物遗传育种与繁殖、动物病原生物学

一级学科硕士点：畜牧学、兽医学、水产

二级学科硕士点：动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、动物性食品安全、水生生物学

专业硕士学位类别：兽医

专业硕士学位领域：畜牧

安徽省A类重点学科：畜牧学

安徽省B类重点学科：动物遗传育种与繁殖学、预防兽医学

截至2020年5月，学院有教职工94人，其中教授27名，副教授34名，讲师13人，高级实验师5人，实验师4人。教师中有国家现代农业产业技术体系岗位专家2名，安徽省现代农业产业技术体系首席、副首席专家各1名，安徽省体系岗位专家22名；入选“安徽省‘三区’科技人才扶贫计划”十多名，入选安徽省现代生态农业产业化指导专家组十多名，入选省“绿色低碳循环畜牧业技术示范点名单及专家团队”十多名；1人担任江淮分水岭综合试验站站长，2人担任皖西综合试验站、皖西北综合试验站产业联盟首席专家；有省级教学名师1名、省级教坛新秀1名、享受国务院津贴4人、享受省政府津贴8人。

截至2020年5月，学院有国家综合改革试点专业1个、国家特色示范专业1个、安徽省高水平大学建设专业1个、安徽省综合改革试点专业1个。

国家综合改革试点专业：动物科学

国家特色示范专业：兽医学

国家精品课程：动物病理学

安徽省高水平大学建设专业：动物医学

安徽省综合改革试点专业：水产养殖学

安徽省精品课程：动物遗传学

截至2020年5月，学院有安徽省“115”产业创新团队2个、安徽省重点实验室2个、安徽省技术研究院1个、安徽省质量与安全检测中心1个，与企业共建获批省级工程技术研究中心2个、院士工作站5个。

安徽省重点实验室：地方畜禽遗传资源保护与生物育种安徽省重点实验室、兽医学病理生物学与疫病防控安徽省重点实验室

安徽省技术研究院：安徽省畜禽产业共性技术研究院

安徽省质量与安全检测中心：安徽省饲料质量与安全检测中心

安徽省工程技术研究中心：安徽省畜牧生物工程技术研究中心、安徽省羊繁育工程技术研究中心

截至2020年5月，近5年，学院主持国家及省市等科研项目310多项，获得各类省部级科技奖励8项，其中一等奖2项、二等奖1项、三等奖5项；主持或参与获得其他各类科技奖励5项，发表论文（著）600余篇（部），授权发明专利110多项，主持起草通过28个地方标准、1个行业标准，新发现1个国家级品种资源——皖东牛，培育出国家级家禽新品系1个。

截至2020年5月，近年来，学院先后与中国农业大学畜牧兽医研究所、中国农业科学院、扬州大学、西北农林科技大学、福建农林大学等多所中国国内高校以及美国、英国、瑞士、捷克等多个国家的科研院所开展人才联合培养、学术交流和科研合作，先后承办中国国内外会议20多场次，有十多位教师在国际学术大会上作学术交流报告。

心联会：致力于发现和解决班级同学们的心理问题，开展心理知识竞赛、心理情景剧等活动，开展心理健康讲座。

健美操队：曾获校健美操比赛一等奖和二等奖等荣誉。

藏舞队：弘扬藏族的舞蹈文化

科创部：主要围绕学院“创新创业”人才培养开展各类提升学院学生科技、学术、学习氛围的活动，举办爱农杯、大学生职业生涯规划、动物外科手术世界技能大赛、生态瓶制作大赛、野生动物习性介绍大赛等活动。

志愿者队：在社会上进行一些志愿者活动。

礼仪队：主要负责学院各种大小型活动的礼仪接待和颁奖工作。

素质拓展部：开展素质拓展活动，下设辩论队。

体育部：组建有院足球队、羽毛球队、篮球队、田径队、排球队。