截至2022年10月，全国已设置12个国家医学中心，包括：
国家心血管病中心、
国家癌症中心、
国家老年医学中心、
国家儿童医学中心、国家创伤医学中心、
国家呼吸医学中心、国家重大
公共卫生事件医学中心、国家
口腔医学中心、国家神经疾病医学中心、国家传染病医学中心等。
2017年开始，国家卫生和计划生育委员会印发《“十三五”国家医学中心及国家区域医疗中心设置规划》（国卫医发〔2017〕3号），启动国家医学中心和国家区域医疗中心规划设置工作，依托高水平医院设置国家医学中心和国家区域医疗中心，打造医学高地，提升整体和区域医疗服务能力，减少患者跨区域就医，助力分级诊疗制度建设。
《“十三五”国家医学中心及国家区域医疗中心设置规划》明确，到2020年，依托现有的三级医疗服务体系，合理规划与设置国家医学中心及国家区域医疗中心，进一步完善区域间优质医疗资源配置，整合推进区域医疗资源共享，促进医疗服务
同质化，逐步实现区域分开，推动
公立医院科学发展，为实现分级诊疗创造条件。
根据规划，国家医学中心将在疑难危重症诊断与治疗、高层次医学人才培养、高水平
基础医学研究等方面有力发挥牵头作用。到2020年，中国将在全国范围内按综合和不同专科类别设置国家医学中心，并在各省设置建设1个综合类别的国家区域医疗中心，推动医疗
供给侧结构性改革，助力形成科学有序的就医格局。
国家传染病医学中心（复旦大学附属华山医院、首都医科大学附属北京地坛医院、
浙江大学医学院附属第一医院）