莲花镇位于衢江区东北部，距城二十七公里，云丰公路直达，东与十里丰农场、龙游县相邻，北通省城，铜山源、芝溪穿镇而过，面积72.2平方千米。

唐武德四年（621年），莲花镇境域属白石县。

唐如意元年（692年），属盈川县。

唐元和七年（812年），并入信安县。

宋、元代，属西安县。

明代，属钦化乡白石里。

清康熙帝元年（1662年），为盈川九都。

民国四年（1915年），设第十七区，属衢县。民国九年（1920年），改设莲花镇。民国十九年（1930年），为莲西镇，属第五区。民国二十二年（1933年），分设莲花、五西、古西、蒋4乡。民国二十五年（1936年），复设莲花镇，华侨、五枧乡和莲西镇并入，属衢县。民国二十八年（1939年），属杜泽区。民国三十二年（1943年），属杜泽区署。民国三十四年（1945年），属杜泽区。民国三十七年（1948年），改设莲花乡。

1950年，分设莲花、外黄、大乘3乡，属杜泽区。

1958年，改设五坦、外黄管理区，属杜泽（高潮）公社。

1961年9月，设莲花、外黄公社。

1984年1月，复设莲花、外黄乡。

1992年5月，外黄乡并入莲花乡后重设莲花镇，属衢县。

2001年12月，属衢江区。

2011年，莲花镇有耕地面积3.1万亩，林地面积5.2万亩。

下辖23个行政村：莲花村、莲东村、东湖村、犁金园村、上余村、清莲村、桥丰村、五坦村、西山下村、杜山沿村、涧峰村、月山村、华村、耿山村、外黄村、缸窑头村、桥东村、山外村、里黄村、朱杨村、黄营村、毛桐山村、大路口村。

截至2011年末，莲花镇辖区总人口34418人，其中城镇常住人口4035人，城镇化率11.7%，另有流动人口6003人。总人口中，男性17634人，占51.2%；女性16784人，占48.8%；14岁以下5576人，占16.2%；15~64岁24120人，占70.1%；65岁以上4722人，占13.7%。总人口中，以汉族为主，达34143人，占99.2%；有白、、侗、壮等13个少数民族，共275人，占0.8%，其中白族75人，占少数民族人口的27.3%；畲族43人，占15.6%，人口密度为每平方千米471人。截至2019年末，莲花镇户籍人口为36912人。

2011年，莲花镇财政总收入1428万元，比上年增长110.9%，其中地方财政收入357万元，比上年增长128.8%，人均财政收入415元，农民人均纯收入9906元。

2019年，莲花镇有工业企业5个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市15个。

2011年，莲花镇农业以种植业为主，农业总产值4.7亿元，比上年增长307.8%，农业增加值占全镇地区生产总值的54.0%，生产粮食2.6万吨，其中水稻2.5万吨，小麦50吨，油菜种植面积5123亩，产量606吨；蔬菜种植面积8112亩，产量1.1万吨；花卉种植面积3000亩，产量1500吨，生猪饲养量50万头，年末存栏12万头；家禽饲养量160万羽，上市家禽100万羽，生产禽蛋7500吨。

2011年，莲花镇工业总产值2.68亿元，比上年增长42.9%，工业增加值占全镇地区生产总值的36.0%，规模以上工业企业13家，实现工业增加值1.89亿元，比上年增长46.2%。

2011年末，莲花镇有商业网点266个，社会商品销售总额达1.1亿元，比上年增长36.9%；城乡集市贸易成交额2.36亿元，比上年增长45.7%，出口2400万美元，比上年增长11.2%。

2011年，莲花镇有各类存款余额1.6亿元，各项贷款余额0.5亿元。

2011年，莲花镇邮政业务收入30万元，全年电信业务收入450万元。

2011年，莲花镇接待游客3万人次，旅游收入300万元。

2011年末，莲花镇有幼儿园10所，在园幼儿435人，专任教师32人；小学2所，在校生1745人，专任教师135人，小学适龄儿童入学率100%；初中1所，在校生939人，专任教师87人，初中适龄人口入学率、小升初升学率、九年义务教育覆盖率均达100%，教育经费达2289.1万元，比上年增长-12.7%，财政预算内教育经费2106万元，比上年增长-12.5%，占财政总支出的比例为30%。

2011年末，莲花镇文化艺术团体16个，会员312个；业余创作队伍5个，创作人员41人；文化专业户21个，镇综合文化站1个，村文化活动室23个，老年活动中心15个；公共图书室25个，藏书3.80万册。

2011年末，莲花镇有各级各类医疗卫生机构33个，病床30张，固定资产总值905万元，专业卫生人员66人，其中执业医师10人，执业助理医师11人，注册护士5人，医疗机构（门诊部以上）完成诊疗49870人次，农村安全饮用水普及率100%，农村卫生厕所普及率100%，新型农村合作医疗参合人数23583人，参合率95.0%。

2011年，莲花镇城镇最低生活保障户数4户，人数6人，支出8640元，比上年增长33.0%，月人均120元，比上年增长11.9%，农村最低生活保障户数742户，人数1290人，支出166.8万元，比上年增长22.0%，月人均109元，比上年增长11.2%；五保供养55人，支出40万元；农村医疗救助135人次，支出66.4万元；农村临时救济281人次，支出6.4万元。国家抚恤、补助各类优抚对象217人，抚恤事业费支出107.86万元。敬老院1家，床位100张；社区服务中心8个，参加城乡居民基本养老保险23583人，参保率95.0%。

2011年末，莲花镇有邮政网点1个，投递路线单程总长度61.3千米，乡村通邮率100%。电信企业1家，服务网点8个，固定电话用户8081户，移动电话用户28557户，宽带接入用户4381户。

2011年末，莲花镇镇区有主变压器2台，总容量9兆伏安，高压输电线路2条，总长度8千米，用电负荷7260千瓦。年售电量累计完成1278万千瓦时。

2011年末，莲花镇镇区有公园2个，公园面积1.2公顷，园林绿地面积4.8公顷，其中公共绿地3.2公顷，绿化覆盖率21%。

2020年11月11日，被中共浙江承宣布政使司委、浙江省人民政府表彰为浙江省抗击新冠肺炎疫情先进集体。

2020年11月11日，被评为浙江省先进基层党组织。

2021年11月，莲花镇入选第二批全国乡村治理示范乡镇。