纳土纳海（Natuna Sea）是位于南海西南部的海域，北面与南海以纳土纳群岛和阿南巴斯群岛为界；南面经卡里马塔海峡和加斯帕海峡通爪哇海；西面通过宾坦岛和马来半岛之间的海域连接新加坡海峡和马六甲海峡，长650千米，宽450千米，面积38万平方千米，平均50米水深，最深109米。

纳土纳海域岛屿众多，东北侧为纳土纳群岛，北有阿南巴斯群岛，西侧有廖内群岛、林加群岛。南部也有岛屿而且较大，有邦加岛、勿里洞岛和卡里马塔群岛。海域中部还有淡美兰群岛、珀彦坦群岛等。加里曼丹岛和苏门答腊岛为平原海岸，海岸低平多沼泽，岸边断续分布有红树林，其他岛屿周围多珊瑚礁。流入海区的河流数量多，但都较短，最长的是西加里曼丹岛上的卡布阿斯河(1150千米），苏门答腊岛上有甘巴河、关坦河、穆西河等。该海域被赤道横贯，气候高温多雨，海域资源丰富，生产热带经济作物。

早在公元1200年，纳土纳海域已有船只往返斯里维贾亚的航行记录。纳土纳海位于太平洋和印度洋重要航线上，北上可通南海，南下可至爪哇海，并经爪哇海东至印度尼西亚诸岛间海，或向南经巽他海峡、龙目海峡入印度洋，向西可经新加坡海峡入马六甲海峡，在交通和军事上都具有十分重要的价值。2017年7月16日，印度尼西亚公布将南海部分海域重命名为“北纳土纳海”的地图，引发中国与印度尼西亚外交关系紧张。

公元7世纪，纳土纳群岛西部斯里维贾亚（室利佛逝）海洋王国控制着通过北部航道，西至马六甲海峡（Malak），东抵爪哇海（Jawa）。公元671年，一位名叫易青的中国僧侣曾在纳土纳群岛停留并到达斯里维贾亚，在其书中讲述前往停留在一簇簇岛屿上的故事，该岛屿有大有小，并称大岛为“NAN TOA”，“NAN”意为岛，“TOA”意为大岛，后被马来族说成“Natuna”，这是纳土纳（Natuna）的最初命名。之后，斯里维贾亚王国被爪哇的满者伯夷国（Majapahit）取代，纳土纳群岛受制于满者伯夷，包括勿刹岛（Pulau Besar），即今纳土纳大岛。而纳土纳海的命名是由于其海区的东北部有北、大、南纳土纳群岛。

纳土纳海位于0.5°N-0°30'N、106.75°E-106° 45'E之间。长650千米、宽450千米、面积38万平方千米、平均50米水深，最深109米。东北界为劳特岛、小苏比岛和加里曼丹岛西北的达都角的连线；西北界是劳特岛、阿南巴斯群岛中的芒凯岛和宾坦岛的帕拉基特角的连线，通过宾坦岛和马来半岛之间的海域向西接新加坡海峡和马六甲海峡，再向西通印度洋；西界是苏门答腊岛的东北岸；南界为邦加岛东端的伯里卡特角、勿里洞岛和加里曼丹岛西北的桑巴角的连线，向南经卡里马塔海峡和加斯帕海峡通爪哇海；东界为加里曼丹岛的西海岸。

纳土纳海的形成是一个非常复杂的过程，历时近数百万年，伴随着东亚陆缘南段、南海南部的南沙地块及其周缘地带而形成，在中生代中晚期以来受欧亚、印一澳、太平洋三大板块之间相互作用的影响，形成复杂多样的岩浆活动产物。依据超基性岩带的分布表明，白垩纪或侏罗纪至晚白垩世时在巽他古陆东段，即西南西加里曼丹的北侧和东北侧存在洋壳，即所谓古南海。古南海西端始于纳土纳岛，向东则包括现今的西布带、沙巴州、巴拉望、班乃、以及东南加里曼丹和西苏拉威西省。古南海向东敞开而与古太平洋相连，因为当时菲律宾群岛在赤道以南，直到中新世才运移到达南海附近。现已查明的蛇绿岩年龄有侏罗纪一白垩纪、早白垩世、晚白垩世及古新世一始新世，以早白垩世为主，未发现更晚的。这指示了古南海洋壳的年龄。在晚白垩世到早第三纪期间发生了古南海向西加里曼丹陆块的俯冲。南沙微陆块——加里曼丹陆块的碰撞(即古南海俯冲的结束)在西段从晚始新世就发生了，向东则逐渐变晚到早中新世，与南海扩张结束的时间大致相同。

始新世，太平洋板块与欧亚大陆的碰撞导致俯冲活动停止，板块由于重力作用而坍塌；海面的扩张导致西纳土纳盆地的形成。渐新世早期，西纳土纳盆地开始发育，裂谷和拉开作用主要产生西南-东北地区半地堑，盆地充满非海洋沉积物；同时，纳土纳群岛形成西纳土纳盆地、东纳土纳盆地和纳土纳拱的构造，并由纳土纳拱将两个盆地隔开。

中新世早期，西纳土纳盆地压缩力占主导地位，导致正常断层的反向运动和以前半地堑区域的相应隆起；东纳土纳盆地受拉力影响，产生NW-SE右向运动及SW-NE正断层，并遭遇浅层沉积和深海相沉积，其最古老的沉积物是来自晚渐新世的冲积层和三角洲平原沉积。

纳土纳海属于南海支海，海域盐度基本为33‰，自外海向近岸盐度逐渐降低，大部分近岸区域年平均盐度在32‰以下；平均盐度冬季高、夏季低。

海水密度冬季高、夏季低，自外海向近岸递减，外海深水区的表层密度多在21.5—23.5之间，沿岸浅水区表层密度小于20，春季随着海面增温和风力减弱，表层密度减小，均匀层变薄；而秋季恰与春季相反。

注入纳土纳海的的河流数量多，但流程短。苏门答腊岛上有甘巴河、关坦河、捷詹河、穆西河等式，西加里曼丹岛上的卡布阿斯河和班达克河等，其中卡布阿斯河最长（1150公里）。

纳土纳海地处热带，赤道横贯海域中部，气候高温多雨，为热带雨林气候。苏门答腊岛沿岸年均气温达26℃，年均降水量2000～3000毫米。该地区气候受风向变化影响大，风速值在0.1~6.7米/秒之间。群岛5~10月间一般无风暴，风暴主要集中在12月。当地人根据风向来区分四个季节，即北、东、南、西季。其中，每年11~次年2月为北季，特点是风从东边吹来，风速很大，达到15~30节，海浪昼夜高1~3米；3~6月为东季，特点是风从东方吹来，平均风速12节，大雨很少见，并伴随炎热，热量相当强烈；7~8月为南季，特点是风从南方吹来，平均风速8~20节，阳光明媚，炎热无比，海面波涛汹涌；9 ~10月为西季，特点是风从西边吹来，暑雨交替，海面变化无常。

纳土纳海底的西纳土纳盆地构造复杂，经历了晚始新世渐新世伸展断陷、早中新世坳陷、中中新世挤压反转三个阶段，晚中新世后构造较稳定，沉积了厚600~750米、分布广泛的Muda组沉积，其向东的盆地中心区域增厚。

纳土纳海域附近地形较复杂，等深线不规则弯曲，岛屿、浅滩、沟谷和洼地甚多；群岛之间分布着大小和形态不同的槽谷。其中，北纳土纳群岛南北两侧的两条槽谷比周围海底低20~30米；群岛与加里曼丹岛西北端附近海岸之间为阿皮海峡（Api），该海峡东南岸地势低洼，岸外的浅滩和浅水区向外延伸较远。纳土纳群岛系地势高而多山的群岛，从西北至东南延伸190海里，岛上主要为热带森林，岛屿多为丘陵和岩石土地，低地和倾斜的平原主要分布于沿海地区；岛屿间平均海拔差异大，从3~1035米不等，坡度在2~5米之间。

纳土纳海底的西纳土纳盆地属于典型的陆内裂谷盆地，先后经历了裂谷、裂后、挤压反转和构造稳定４个构造演化阶段，沉积体系从河流－三角洲－湖泊沉积过渡到浅海沉积，晚始新世—早渐新世裂谷阶段，在印度、澳大利亚板块与欧亚板块碰撞造成巽他陆块解体的区域背景下，盆地在裂谷早期发生伸展构造活动，形成一系列孤立的 ＮＥ-ＳＷ向延伸的地堑和半地堑，充填冲积扇冲积平原相粗粒碎屑沉积。至早渐新世，构造活动相对减弱，断层活动主要集中在地堑和半地堑边界断层附近，早期孤立的地堑、半地堑最终连接形成 ＮＥ-ＳＷ向的大型沉积中心，盆地进入湖侵沉积阶段，湖泊体系扩张，发育厚层泥岩；晚渐新世—早中新世裂后阶段，盆地构造活动相对稳定，沉积速率明显大于沉降速率。盆地早期处于湖退沉积阶段，开始接受进积式河流－三角洲碎屑沉积，晚期受海侵事件影响，盆地中东部和东北部地区沉积滨浅海相泥岩；早中新世—中中新世挤压反转阶段，板块间碰撞速率和角度的变化造成巽他陆架区域性挤压隆升，其中西纳土纳盆地的挤压反转运动与从马来盆地延伸至盆地内ＮＷ-ＳＥ向走滑断层的构造活动有关。在走滑断层右旋压扭的作用下，早期地堑或凹陷中心发生反转形成一系列挤压背斜、断背斜，这些背斜构造是盆地油气聚集成藏的有利场所。石炭纪以来，西马东部和沙巴砂拉越沙捞越西南部拼合，形成了与中原地区板块相关的印支（Indochina）陆块；二叠纪晚期，随着古特提斯洋关闭，西马西部与西马东部拼合，并在西马发育一系列岩浆岩；燕山期以来，马来西亚东西两侧分别受太平洋板块和印度洋板块的挤压、俯冲作用，形成了马来半岛和古晋市两个增生带。

纳土纳海域岛屿众多，东北侧为纳土纳群岛，北有阿南巴斯群岛，西侧有廖内群岛、林加群岛。南部也有岛屿而且较大，有邦加岛、勿里洞岛和卡里马塔群岛。海域中部还有淡美兰群岛、珀彦坦群岛等。

加里曼丹岛（英语、印尼语：Kalimantan），又称婆罗洲（Borneo），为世界第三大岛、亚洲第一大岛，是大巽他群岛的一部分，也是马来群岛中最大岛屿，东北至西南长度为1336千米，最宽为960千米，面积74.33万平方千米。加里曼丹岛全境由印度尼西亚、马来西亚及文莱三国管辖。全岛人口约1135万。

纳土纳群岛（英语：Natuna Archipelago，印尼语：Kabupaten Natuna）位于马来半岛和加里曼丹岛之间的最南端，是印度尼西亚最北端岛群，面积约2110平方千米。该群岛由272个岛屿组成，分为北纳土纳群岛、中纳土纳群岛和南纳土纳群岛三部分，主要岛屿有邦古兰岛、劳特岛、渚碧岛等。纳土纳群岛由印度尼西亚廖内群岛省管辖，约27个岛有人居住，截至2023年，人口数为84110人。

廖内群岛 (英语：Kepulauan Riau)是印度尼西亚的一个岛群，位于新加坡海峡之南，马六甲海峡东口，东临南海，交通位置重要。由宾坦、巴淡和加里梦等大小数百个岛屿组成，总面积约3,835平方公里，人口约8万。

阿南巴斯群岛是印度尼西亚西北部的一个岛群。

邦加岛（英语：Bangka）位于苏门答腊岛东面，隔邦加海峡，西隔加斯帕海峡至勿里洞岛，南临爪哇海。邦加岛属丘陵地，由古生代至中生代初期的千枚岩、砂岩和三叠纪花岗石所组成，石灰岩稀少，三叠纪花岗岩广泛侵位在泥岩、片岩和千枚岩中，但出露规模小。邦加岛上集中了一些储量最大的砂锡矿床，自1710年以来，在这里开采了100多万吨锡，占印度尼西亚砂锡产量的三分之二。

纳土纳海地区的土壤分布受到热带气候、地形和火山石、变质岩等母质的共同影响。例如纳土纳群岛土壤由红色、黄色的豆荚质土壤组成，土壤基部是花岗石，冲积土以及有机质土壤和腐殖质。群岛以东至曾母暗沙水域水深200~500米的外陆架分布有残留砂，属生物屑细砂；群岛以西为砂与黏土的混合沉积，现附近岛屿的短程河流已无力供沙，为经改造的残留砂（变余沉积）。

纳土纳海域绝大部分为印度尼西亚领海，大部分属西加里曼丹、廖内群岛省和邦加—勿里洞省。苏门答腊岛盛产石油，邦加—勿里洞岛盛产锡矿，为东南亚锡矿带最南端，邦加、勿里洞岛有“锡岛”之称，是世界著名锡矿带的重要组成部分。还有铁、铜、铅等矿。

海域资源丰富，海区盛产热带鱼类，各岛盛产热带经济作物。纳土纳海拥有丰富的自然资源和各种海洋产品，具有巨大的开发潜力。2011年纳土纳海洋鱼类资源潜力为每年 04,212.85吨。捕捞地点位于纳土纳海外 4 海里处。

纳土纳海地区主要以热带植被为主，海区内岛屿上生长着各种植物，如橡胶、椰子、丁香、咖啡和胡椒等。约8.5%，面积16,854公顷的土地被耕种，森林面积达226,898公顷，其中包括受保护森林约4700公顷，红树林约1942公顷。包括位于拉奈岛的佩林红树林（Pering Mangrove）等。

纳土纳海地区拥有丰富的生物多样性，包括许多特有物种。纳土纳群岛邻近水域有五颜六色的珊瑚礁。附近群岛上生活的动物包括蛇、猴子、小鼷鹿、果子狸、鳞甲目、绿海龟、乌龟、鸳鸯、巨蜥属、和各种鸟类如鹦鹉、鹳、鹰、犀鸟科、燕子等；其中塞米恩岛是绿海龟栖息地。群岛有71种鸟类登记在册，包括濒临灭绝的小鱼鹰、纳土纳蛇雕、银鸽。纳土纳岛叶猴（Presbytus natunae）是地球上25种最濒危灵长目之一，目前共约有5000~7000只。群岛记录有55种内陆鱼类，其中21种为淡水鱼类，包括波鱼（Rasbora bunguranensis）、Betta aurigans（斗鱼属的一种）两种群岛特有淡水物种，以及岛鲶（Silurichthys insulanus）、 银鲫（Clarias rennyae）两种淡水鲇形目。

公元671年，一位名叫易青的中原地区僧侣前往斯里维贾亚王国，途经众多岛屿，并称其为“NAN TOA”，马来族说成纳土纳（Natuna），这是纳土纳历史的开始。公元1200年，纳土纳大岛已是往返斯里维贾亚的船只在中途停留地。

中原地区宋代，纳土纳群岛作为中国与外国的海域分界，称“锅盖屿”；明代称“万生石塘屿”，并作为南疆重要标志记载于《郑和航海图》。1433年，潮汕人曾沅芳受皇帝手谕携家眷住守“万生石塘屿”，并享“住留该岛，永远不纳赋税”之政策，故改称“安不纳岛”。曾沅芳妻子活到90多岁，被尊为“曾母”，人们以其姓氏将“安不纳群岛”西部一组岛屿称为“曾母西群岛”，即印度尼西亚“亚南巴斯群岛（Anambas archipelago）”；将“安不纳群岛”南部一组岛屿称为“曾母南群岛”，即印尼“坦贝兰群岛（Tambelan archipelago）”。

纳土纳海域位于太平洋和印度洋重要航线上，北上可通南海，南下可至爪哇海，并经爪哇海东至印度尼西亚诸岛间海，或向南经巽他海峡、龙目海峡入印度洋，向西可经新加坡海峡入马六甲海峡，在交通和军事上都具有十分重要的价值。沿岸重要港口有：新加坡，世界著名港口和转运站；巨港，印度尼西亚重要的石油工业基地；邦加岛上的槟港，为印度尼西亚重要的海军基地。

20世纪80年代末，印尼国家石油公司与美国艾克森石油公司合作，投资数百亿美元在纳土纳海域开采石油与天然气。2008年起，印度尼西亚与八国联合开发纳土纳群岛天然气。

印度尼西亚的海上乌当油田位于印尼的纳土纳海(NatunaSea)，在雅加达以北1000公里和新加坡东北300公里处。乌当油田是由印度尼西亚的波塔米那公司(PertaminaCo.)和大陆石油公司(ContinentalOilCo.)联合勘探发现的。从1974年7月开始钻探井到1978年底为勘探阶段；从1979年1月到1981年9月为开发阶段。79年初到82年初约三年时间共采油333.3万吨。1981年10月初的最高日产汽车公司油量为5333.3吨，1985年4月油田日产油量下降至1600吨。

2003年印度尼西亚石油蕴藏量为5.5亿公吨、天然气为2.56兆立方米。除了位于苏门答腊岛中部内陆的两个陆上油田外，其他重要产区则位于西北爪哇外海、东加里曼丹省及纳土纳海等海域。

纳土纳海域内的岛屿地区正在下沉，沉降率平均超过0.2毫米/年。由于巽他大陆架上的珊瑚礁通常小于10千米，仅在第四纪发育，包括纳土纳岛在内的整个巽他大陆架，自更新世以来一直在消退。纳土纳群岛的小环礁最近消亡发生在2001年至2006年之间。

塞达瑙岛（Sedanau Island）位于西邦古兰区，岛上的梅尔玛瓦市（Mermarwah City）又称为漂浮城市，许多当地房屋都居住在海上，房子是用木头建造的，排列整齐。岛上主要旅游景点还有巴西马鲁斯海滩（Pasir Marus Beach）等。

阿里夫石公园（Alif Stone Park）位于纳土纳东邦古兰分区雪邦邦村（Sepempang），由沙滩，海水和巨石组成，总面积约3公顷。公园主要特征是位于海岸线上自史前时代以来的一种花岗石，据当地人说，其中一块石头代表了阿拉伯字母“Alif”的形状，此地因此得名。

纳土纳科威特大清真寺（Natuna Grand Mosque）是纳土纳的地标，位于东邦古兰区。许多人称这座清真寺为印度尼西亚的泰姬陵，是廖内群岛省最宏伟的清真寺，一排沙夫可容纳180群会众。该清真寺占地5500平方米，可同时容纳10000人礼拜；中部圆顶以绿色和黄色为主，象征着古兰经；四个角落有4个尖塔，高度为17米，代表拉卡特（rakaat）祈祷5次的次数；20扇门中有3扇朝北的大门。

拿督卡亚穆罕默德二世纪念碑（Datuk Kaya Muhammad II Monument）位于Sekatung岛。纪念碑位于海岸并面向大海，高14米，重2吨。督卡亚穆罕默德二世在荷兰和日本统治期间发挥了重要作用，由于他的勇敢和坚韧，当地人决定建造这座纪念碑作为斗争和历史的象征。

塞茜海滩（Sisi Beach）位于塞拉桑区，曾是世界上最好的原始海滩之一。海滩从Payak村延伸到Jermalik的Resak Cape，悬崖位于海岸线的后方，白色沙滩覆盖长约7千米的海岸线，海水清澈见底，波浪很大。参观Sisi海滩的最佳时间是在“Lebaran”期间，当地人会进行拔河、划独木舟等比赛。

纳土纳海因其位置，牵涉中国、越南、马来西亚、菲律宾和文莱等国利益。其中，越南与印度尼西亚在大陆架边界为一条越南南部海岸与印度尼西亚纳土纳群岛的中间线；印度尼西亚与中国在纳土纳群岛海域存在海洋划界争议。

2014年10月至2016年1月，印度尼西亚就抓扣157艘外国非法捕捞船，其中炸沉121艘。仅2017年，印度尼西亚共计在纳土纳海域抓获75艘非法捕捞船，其中，63艘来自越南，其他分别来自周边邻国，如马来西亚、菲律宾等。

2016年8月，印度尼西亚就已经宣布将与南海重叠的海域更名为北纳土纳海。2017年7月，印度尼西亚发行更名的新版地图，引发了中国的强烈抗议，但印度尼西亚却以纳土纳周边海域属于印度尼西亚专属经济区而不是属于中国南海为由，认为所谓更名完全是印度尼西亚主权范围内做的事情。